Akademik Veri Yönetim Sistemi
Yıldırım K., Kurt Kızıldoğan A. (Yürütücü)
TÜBİTAK Projesi, 2021 - 2022
Projenin ana amacı, ağır metal toleransı yüksek olan Purpureocillium sp.CB1 suşunun yüksek kadmiyuma karşı gösterdiği toleransın altında yatan gen ifade değişimlerinin ve moleküler yolakların RNA sekanslama ile karşılaştırmalı olarak tespit edilmesidir. Bu sayede bu fungus türünün ağır metal toleransının moleküler temeli ilk defa açığa çıkarılacak ve keşfedilecek genlerin ile moleküler yolakların biyoremediasyon çalışmalarında kullanılması mümkün olacaktır.
Bu amaç doğrultusunda projenin hedefleri şu şekilde sıralanabilir.
1. Logaritmik fazdaki (T72) Purpureocillium sp. CB1 kültürünün iki farklı kadmiyum konsantrasyonuna (0 mg/l [kontrol], 500 mg/l ve 2500 mg/l) maruz bırakılarak, iki farklı zamanda (6. [T78] ve 36. [T108] saatlerde) örneklerin toplanması.
2. Toplanan örneklerden RNA izole edilmesi,
3. RNA sekans analizinin yapılması.
4. Sonuçların biyoinformatik analizleri ile Purpureocillium sp. CB1 suşunun Cd2+ stresine yanıtında rol oynayan genlerin ve ana yolakların belirlenmesi ve RNA-seq datasının RT-qPCR temelli verifikasyonu.
RNA için örneklem yapılan her konsantrasyon ve zaman parametresinde kültürlerden örneklerin alınması ve santrifüj sonrasında elde edilen süpernatanların ICP-OES analizlerinde kullanılarak besiyerinde kalan Cd2+ miktarının belirlenmesi. Taramalı elektron mikroskobu (SEM) ile kontrole kıyasla farklı konsantrasyonlarda ( 500 mg/l ve 2500 mg/l) kadmiyum stresi sonrasında 6. ve 36. saatlerdeki hücre yüzey profillerinin karşılaştırılması.