Boğa Epididimal Spermasından Toplam RNA İzolasyonu: Kriyoprezervasyonun Etkisi


Kaya C.

5th International Conference on Frontiers in Academic Research, Konya, Türkiye, 25 - 26 Eylül 2025, ss.73-79, (Tam Metin Bildiri)

  • Yayın Türü: Bildiri / Tam Metin Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Konya
  • Basıldığı Ülke: Türkiye
  • Sayfa Sayıları: ss.73-79
  • Ondokuz Mayıs Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Bu çalışmada, boğa epididimal spermalarından elde edilen RNA'nın verim ve saflık özellikleri üzerine kriyoprezervasyonun etkisi araştırılmıştır. Olgun spermatozoalar, ribozomal RNA açısından sınırlı ancak küçük düzenleyici RNA'lar açısından zengin bir yapıya sahiptir ve bu özellikleriyle epigenetik bilgi taşıyıcıları olarak öne çıkmaktadırlar. Ancak kriyoprezervasyon işlemi spermatozoanın membran bütünlüğünü bozarak RNA kaybına veya degradasyonuna neden olabilmektedir. Bu bağlamda, taze ve dondurulmuş-çözülmüş epididimal sperma örneklerinden TRIzol bazlı yöntem kullanılarak RNA izolasyonu yapılmış; verim (ng/μL) ve saflık (A₂₆₀/A₂₈₀, A₂₆₀/A₂₃₀) parametreleri spektrofotometrik olarak karşılaştırılmıştır. Bulgular, dondurulup çözülen grupta RNA veriminin önemli ölçüde azaldığını (p = 0,029), ancak A₂₆₀/A₂₈₀ oranında sınırda bir iyileşme olduğunu (p = 0,050) gösterdi. Gruplar arasında A₂₆₀/A₂₃₀ oranı açısından istatistiksel olarak anlamlı bir fark gözlenmedi (p = 0,124). Elde edilen sonuçlar, kriyoprezervasyonun sperma RNA verimi üzerinde olumsuz etkileri olduğunu, ancak bazı kontaminantların ortadan kaldırılmasıyla saflıkta kısmi bir iyileşme sağlanabileceğini ortaya koymaktadır. Bu bulgular, kriyoprezervasyondan sonra elde edilen sperma RNA'sının özellikle hedefli moleküler analizler (örneğin, miRNA-seq) için hala kullanılabileceğini, ancak büyük ölçekli transkriptomik çalışmalar için ek saflaştırma ve kalite kontrol adımlarının gerekli olduğunu göstermektedir.

Anahtar Kelimeler –Epididimal sperm; Kriyoprezervasyon; RNA izolasyonu; RNA saflığı; TRIzol