Phytochemical profiling, molecular docking and ADMET prediction of crude extract of Atriplex nitens Schkuhr for the screening of antioxidant and urease inhibitory


Başar Y., Yenigün S., Gül F., Özen T., Demirtaş I., Alma M. H., ...Daha Fazla

International Journal of Chemistry and Technology, cilt.8, sa.1, ss.1-12, 2024 (Hakemli Dergi)

Özet

Dünyanın kurak ve yarı kurak bölgelerinde doğal olarak yetişen Atriplex nitens Schkuhr (ANS), kuraklığa ve tuzlu ortamlara karşı oldukça dayanıklı olup gıda ve hayvan yemi olarak kullanılmaktadır. Bu çalışmada ilk olarak ANS'nin elde edilen metanol ham ekstraktı üzerinde fitokimyasal analiz ile antioksidan ve üreaz inhibisyon aktiviteleri gerçekleştirilmiştir. LC-MS/MS sonuçlarına göre kateşin ve izokersitrin ana bileşikler olarak tespit edildi. Ekstraktın GC-MS/MS analizinde oleik asit metil ester (%31.71), palmitik asit metil ester (%25.87), linoleik asit metil ester (19.61) ve nonakozan (%6.81) tespit edildi. ANS ekstraktının posfomolibden indrgenme, DPPH֗ giderici ve üreaz inhibisyon aktiviteleri sırasıyla 67.27±23.83, 7.85±0.44 ve 6.58±0.48 µg/mL düzeyinde etkili bulunmuştur. Bu araştırmada öncelikle ANS ekstraktının biyolojik aktivitesi ve kimyasal bileşimi incelenmiştir. Bu bitkinin en bol bulunan iki bileşeni üzerinde moleküler yerleştirme ve ADMET tahmini gerçekleştirildi. İzokersitrin üreazının (MolDock skoru -121.42, bağlanma afinitesi -8.60 ve bağlanma sabiti 0.62 µM) üreaz ile etkileşiminin üreaz ile etkileşiminin daha yüksek olduğu belirlendi. Bu iki bileşenin toksisite açısından ihmal edilebilir bir potansiyeli vardır. Boiled Egg grafiği kateşin için önemli bir GIa'ya işaret etmektedir. Ancak izokersitrin BBB veya GLa geçirgenliği gösterdi. Moleküler etkileşimde isokersitrin en iyisidir, ADMET'te ise kateşin en iyisidir. Ana bileşen izokersitrinin mide hastalıkların karşı etkili olabileceği belirlendi ve BBB ile GLa sistemlerinde gözlemlenmemesi desteklendi.