Akademik Veri Yönetim Sistemi
17.Uluslararası Bilimsel Çalışmalar Kongresi (UBCAK), Elazığ, Türkiye, 23 - 24 Ekim 2025, ss.186-187, (Özet Bildiri)
Actinobacteria filumu üyeleri, doğada farklı habitatlarda yayılış gösteren ve ürettiği biyoaktif moleküllerle biyoteknolojik potansiyele sahip mikroorganizmalardır. Bu filum içerisinde sınıflandırılan farklı cinsler arasında Nonomuraea cinsinin üyeleri, sekonder metabolit üretim potansiyelleri nedeniyle biyoteknolojik açıdan oldukça değerlidir. Bu çalışmada, Heybeliada toprağından izole edilen Nonomuraea sp. H1R4 suşunun tüm genomu sekanslanarak tür düzeyinde konumu ve biyoteknolojik kapasitesi araştırılmıştır. Suşun genomu Oxford Nanopore GridION platformu kullanılarak dizilenmiş, elde edilen veriler BV-BRC ve RAST sunucuları aracılığıyla işlenmiştir. Genom uzunluğu 10.205.303 bp, G+C içeriği %70,0 olarak belirlenmiştir. Toplamda 10.199 kodlama yapan gen, 84 RNA bölgesi ve 324 alt sistem tanımlanmıştır. Filogenetik analizlerde, H1R4 suşunun en yakın türlerle 16S rRNA gen benzerliği %98,7–99,3 arasında bulunmuştur. Ancak dDDH (%23,8–27,6) ve ANI (%78,3– 81,6) değerlerinin tür tanımlama eşiklerinin altında kalması, suşun bilinen türlerden genetik olarak farklı ve potansiyel olarak yeni bir tür olduğunu göstermektedir. Ayrıca antiSMASH analizi ile çok sayıda sekonder metabolit gen kümesi tespit edilmiş, bu da suşun biyoteknolojik açıdan umut vadeden bir kaynak olduğunu ortaya koymuştur. Sonuç olarak, Nonomuraea sp. H1R4 suşu hem tür düzeyinde farklılığı hem de geniş metabolit potansiyeli nedeniyle yeni tür tanımlamaları ve biyoteknolojik uygulamalar açısından önemli bir adaydır. Bu çalışma; 2209- A Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı tarafından 1919B012320803 kodlu proje ile desteklenmiştir.
Members of the Actinobacteria phylum are microorganisms that are distributed in diverse habitats in nature and have biotechnological potential due to the bioactive molecules they produce. Among the different genera classified within this phylum, members of the Nonomuraea genus are highly valuable from a biotechnological perspective due to their secondary metabolite production potential. In this study, the whole genome of Nonomuraea sp. H1R4 strain isolated from the soil of Heybeliada was sequenced to investigate its species-level position and biotechnological capacity. The genome of the strain was sequenced using the Oxford Nanopore GridION platform, and the obtained data were processed via BV-BRC and RAST servers. The genome length was determined to be 10,205,303 bp, and the G+C content was 70.0%. A total of 10,199 coding genes, 84 RNA regions, and 324 subsystems were identified. Phylogenetic analyses revealed 98.7–99.3% 16S rRNA gene similarity of strain H1R4 to the closest species. However, dDDH (23.8–27.6%) and ANI (78.3–81.6%) values were below the species identification thresholds, indicating that the strain is genetically distinct from known species and potentially a new species. Furthermore, antiSMASH analysis identified numerous secondary metabolite gene clusters, demonstrating that the strain is a promising biotechnological resource. In conclusion, Nonomuraea sp. H1R4 is an important candidate for new species identification and biotechnological applications due to its distinctness at the species level and broad metabolite potential. This study was supported by the 2209-A University Student Research Projects Support Program under project code 1919B012320803.