Pseudomonas aeruginosa izolatlarında biyofilm üretimi ile antibiyotik dirençlilik ilişkisinin karşılaştırmalı değerlendirilmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Mikrobiyoloji (veteriner) Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2019
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: SERVET EKSELLİ
Danışman: Alper Çiftci
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Amaç: Bu çalışmada çeşitli klinik örneklerden izole edilmiş olan 48 adet Pseudomonas aeruginosa izolatında biyofilm varlığının, antibiyotik dirençliliklerinin ve her 2 fenotipik determinantta rol oynayan ilişkili genlerin belirlenmesi ve aralarındaki ilişkinin karşılaştırmalı olarak değerlendirilmesi amaçlandı. Materyal ve metot: Çalışmada P.aeruginosa izolatlarının identifikasyonları PCR ile doğrulandı. İzolatların antibiyotik direnç durumu Kirby-Bauer Disk Difüzyon metodu ile 6 antibiyotik grubuna ait 8 antibiyotik için belirlendi. İzolatların biyofilm oluşturma durumları in vitro olarak Kongo Red Agar, Modifiye Tüp Aderans ve Mikroplak yöntemleri ile araştırıldı. Her üç yöntemle de biyofilm pozitif olduğu belirlenen izolatların filogenetik yakınlıklarının belirlenmesi amacıyla RADP-PCR gerçekleştirildi. İzolatlarda biyofilm üretiminden sorumlu olan PelA, quorum sensing genleri olan lasI, lasR, rhlI, rhlR ile biyofilme bağlı antibiyotik direncinden sorumlu olan PA0756, PA0757, PA2070 ve PA5033 gen varlıkları PCR ile araştırıldı. Bulgular: İzolatların enrofloksasine %16,67, seftriaksona %60,42, amoksisilin + klavulanik asite %100, siprofloksasine %10,42, meropeneme %29,17, kolistine %4,17, gentamisine %12,5 ve azitromisine karşı %97,9 oranında dirençli olduğu belirlendi. Biyofilm oluşturma durumları CRA metoduna göre 40(%83,33), Christensen Yöntemine göre 45(%93,75) ve Mikroplak Yöntemine göre 31(%64,58) olarak belirlendi. Tüm izolatların pelA, lasI, rhlI ve rhlR genlerine sahip olduğu görüldü. İzolatların %97,92'sinde ise lasR geni belirlendi. İzolatların 46(%95,83) tanesinin PA0756 ve PA0757, 45(%93,75) izolatın ise PA2070 ve PA5033 genlerine sahip olduğu belirlendi. Her üç yöntem ile biyofilm pozitiflik görülen izolatların filogenetik yakınlıkları %56-93 olarak belirlendi. Sonuç: Klinik izolatı P. aeruginosa suşlarında biyofilm üretiminin ve çoklu antibiyotik direncinin yüksek olduğu, genetik düzeyde incelenen genlerin tek başına biyofilm oluşumundan ve buna bağlı antibiyotik direncinden sorumlu olmadığı saptandı. Bu durum farklı ve daha fazla genetik ve fenotipik parametrenin biyofilme bağlı antibiyotik direncinden sorumlu olduğunu gösterdi. Bu durumun belirlenmesi ve biyofilme bağlı antibiyotik direnç mekanizmalarının aydınlatılması için daha geniş ve ileri düzeyde çalışmalar yapılma gerekliliğini gösterdi.