Obez erkeklerde semen mikrobiyomunun yeni nesil dizileme ile fertilite açısından değerlendirilmesi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2023

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: ELZEM NİSA ALKAN

Danışman: Sezgin Güneş

Özet:

Amaç: Tez çalışmasında, obez erkeklerin semenlerinde bulunan mikrobiyal içerik ve çeşitliliğin incelenmesi, infertil ve fertil gruplar arasındaki farklılıkların belirlenmesi, ayrıca seminal mikrobiyotanın semen parametreleri, sperm DNA fragmantasyonu (SDF), sperm kromatin kondensasyonu ve total antioksidan kapasite (TAC) üzerindeki etkilerinin araştırılması hedeflenmiştir. Materyal ve metot: Vücut kitle indeksi (BMI) değeri 30 kg/m2’nin üzerinde olan 18-55 yaşları arasında 13 obez infertil ve kontrol grubu olarak 5 obez fertil erkek çalışmaya dahil edilmiştir. Mikrobiyom analizi için 16S ribozomal RNA geninin V3 ve V4 bölgeleri, yeni nesil dizileme tekniklerinden amplikon dizileme yöntemiyle dizilenmiştir. SDF, TUNEL testi ile; TAC, ELISA testi ile ve histonca zengin sperm yüzdesi, anilin mavisi boyama yöntemi ile analiz edilmiştir. Bulgular: Her iki grupta da en bol bulunan bakterilerin Bacillota, Pseudomonadota, Actinomycetota ve Bacteroidota şubelerine ait olduğu görüldü. Cins düzeyinde en yaygın bulunan bakteriler ise iki grupta da benzer dağılımlara sahip olan Pseudescherichia, Staphylococcus, Paenibacillus, Streptococcus, Klebsiella ve Moraxella olarak belirlendi. TAC değerleri, infertil grupta 2,87 ± 0,21 ve kontrol grubunda 2,69 ± 0,20 ortalamaya sahipti. SDF’in obez infertil erkeklerde (ort: 1,39 ± 3,27), obez fertil erkeklerden (ort: 12,10 ± 4,93) daha yüksek olduğu görüldü. Kontrol grubunda histonca zengin sperm yüzdesi değerlerinin (ort: 33,68 ± 15,65) infertil gruptan (ortalama: 48,15 ± 19,14) daha düşük olduğu gözlemlendi. Ancak, bu farklılıklar istatistiksel olarak anlamlı değildi (sırasıyla, p=0,127; p=0,564; p=0,172). Anilin pozitif sperm yüzdesi ile motilite (p<0,0001), sperm konsantrasyonu (p=0,0001) ve total sperm sayısı (p=0,001) arasında negatif yönlü ilişki gözlendi. Brevibacterium, Paenibacillus, Alistipes, Lactiplantibacillus, Rhizobacter, Sphingomonas ve Veillonella cinslerinin sperm DNA fragmantasyonu; Pantoea, Devosia, Bacteroides, Acidovorax cinslerinin total antioksidan kapasite; Fusobacterium cinsinin anilin pozitif sperm yüzdesi; Corynebacterium, Hydrogenophaga, Paenalcagenes cinslerinin BMI ile korelasyon gösterdiği belirlendi. Sonuç: Semende bulunan bakteri cinsleri, semen kalitesi, sperm DNA fragmantasyonu veya total antioksidan kapasite üzerinde etkili olarak erkek infertilitesinde rol oynuyor olabilir. Çalışma örnekleminin oldukça küçük oluşu (n=18) göz önünde bulundurulduğunda, daha büyük bir örneklem ile daha anlamlı sonuçlar elde edilmesi beklenebilir.