Mastitis izolatı stafilokok suşlarında vankomisin dirençliliğinin fenotipik ve genotipik olarak araştırılması
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Mikrobiyoloji (veteriner) Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2017
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: MEHMET ONUR GÖKDAĞ
Danışman: Alper Çiftci
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Amaç: Bu çalışmada mastitis izolatı stafilokok suşlarında vankomisin dirençliliğinin, diğer bazı antibiyotiklere dirençliliğinin ve bazı virülens faktörlerinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması amaçlanmıştır. Materyal ve metot: Çalışma kapsamında 100 adet stafilokok izolatı incelendi. İzolatlar PCR ile identifiye edildi. Tüm izolatların okzasilin, vankomisin, teikoplanin, trimetoprim-sulfometaksazol, tetrasiklin, penisilin G, sefaperazon ve amoksisilin-klavulonik asite karşı antibiyotik dirençlilikleri Kirby bauer disk difüzyon yöntemi ile belirlendi. Vankomisin dirençli izolatların Minimal İnhibe Edici Konsantrasyonları (MİK)'nın belirlenmesi broth mikro dilüsyon tekniği ile gerçekleştirildi. Vankomisin direnç genotipleri PCR ile belirlendi. Vankomisin dirençli izolatların filogenetik yakınlıkları RAPD-PCR ile araştırıldı. Staphylococcus aureus izolatlarında virülenste rol oynadığı bilinen coa ve spa genlerinin polimorfizmleri PCR ile araştırıldı. Bulgular: İzolatların 73 adeti S. aureus ve 27 adedi de Staphylococcus spp. olarak identifiye edildi. İzolatların 9, 5, 5, 7, 6, 4, 11 ve 17 adedi sırasıyla 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 ve 1 antibiyotiğe karşı dirençli olduğu belirlendi. Otuzaltı adet izolatın tüm antibiyotiklere duyarlı olduğu saptandı. Staphylococcus spp. izolatlarında vankomisin direnci bulunmazken, 9 adet S.aureus izolatında vankomisin direnci belirlendi. Vankomisin dirençli izolatların 2 adetinin 64 μg/ml ve 7 adetinin de 32 μg/ml oranında vankomisine dirençli olduğu saptandı. İki adet izolatın vanA ve 3 adetinin de vanR genini içerdikleri saptandı. Dört adet izolatta ise incelenen direnç genleri belirlenemedi. Vankomisin dirençli suşların %51-75 oranında benzerlik gösteren 9 adet tekli genotip gösterdikleri belirlendi. S. aureus izolatlarından 48 adeti 9 farklı profilde coa polimorfizmi gösterdi. Otuzbeş izolatın ise coa geni içermediği belirlendi. İncelenen 73 adet izolatın spa geni içerdiği ve 4 farklı profilde oldukları saptandı. Sonuç: Mastitis kökenli stafilokok suşlarında vankomisin direncinin belirlendi ve bu suşları içeren sütlerin ve süt ürünlerinin halk sağlığı yönünden bir risk teşkil ettiği kanısına varıldı.