SIĞIR ORİJİNLİ BACILLUS ANTHRACIS İZOLATLARININ ANTİBİYOTİK DİRENÇ PROFİLLERİNİN VE MULTİPLE-LOCUS VARIABLE-NUMBER TANDEM REPEAT ANALYSIS YÖNTEMİ İLE GENOTİPLERİNİN BELİRLENMESİ
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Mikrobiyoloji (veteriner) Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2025
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: AHU KAYALARLI ACARTÜRK
Danışman: Timur Gülhan
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışmada 229 şarbon şüpheli sığır numunesi konvansiyonel metotlarla izole ve identifiye edildi. İzolatlar RT-PCR ile moleküler olarak identifiye edildi ve MLVA25 metodu kullanarak genotiplendirildi. 36 izolat, 4 genotip grubunda dağılım gösterdi, 1. genotip grubu içerisinde sadece Tokat ilinden izole edilen bir suş yerleşim gösterdi. Sivas ve Kayseri illerinde tespit edilen 5 adet izolat ile GG-I içerisinde Tokat ilinden izole edilen suş ile benzer profilde olduğu belirlendi. 1'i Tokat ve 2'si Samsun izolatlarının oluşturduğu GG-II grubunun MLVA'ya göre genetik profili Güney Afrika, Almanya, İtalya ve Avusturya'da izole edilen suşlar ile genetik yakınlığı saptandı. GG-III içerisinde bulunan izolatların Fransa ve İtalya ülkelerinde izole edilen suşlar ile Türkiye'den Sivas ve Mersin illerinden izole edilen suşlar ile benzer genotipik profile sahip olduğu belirlendi. Araştırmada tespit edilen en geniş genotip grubu GG-IV grubu içerisinde bulunan suşların Namibya, Fransa, İtalya ülkelerinden ve Türkiye'de ise Sivas ve Kayseri illerinden izole edilen suşların genotip profilleri ile benzer profilde oldukları tespit edildi. 36 izolatın 5'i (% 13,88) tüm antibiyotiklere duyarlı olup, 21'i (% 58,33), 8'i (% 22,22), 6'sı (% 16,66), 3'ü (% 8,33), 2'si (% 5,55) ve 1'i (% 2,77) sırasıyla sefotaksim, tigesiklin, penisilin, gentamisin, doksisiklin ve eritromisine dirençli bulundu. İzolatların tamamının (% 100) siprofloksasin, vankomisin, levofloksasin, linezolid ve daptomisine karşı duyarlı olduğu tespit edildi. Bölgedeki mihraklardan izole edilen B. anthracis izolatlarında MLVA25 sonucuna göre yaygın genotipin GG-IV olduğu görüldü ve ülkemizden ve Avrupa ülkelerinden bildirilen genotip profillerine benzer olduğu tespit edildi. Penisiline karşı hayvan izolatlarında görülen dirençli suşların dikkat çekici olduğu, bu durumun da yüksek olasılıkla hayvanlarda bilinçsiz antibiyotik kullanımı ile yakından ilişkili olduğu değerlendirildi.