Yüksek tuz toleransına sahip fasulye genotipinde tolerans ile ilgili transkripsiyon faktörlerinin belirlenmesi

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Tarımsal Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2017

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Gökhan Gökdemir

Danışman: Musa Kavas

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Apetala2-ethylene-responsive element binding factor (AP2-ERF) süperailesi gelişimsel ve fizyolojik olarak önemli rollere sahiptir. Fasulye genomunun dizilemesi tamamlandığından dolayı AP2-ERF genlerinin hepsinin tanımlanması mümkün hale gelmiştir. Bu çalışmada biyoinformatik analizler ile 180 AP2-ERF süperailesi geni bulunmuş ve bu genlerden PvAP2-ERF31 geninin karakterizasyonu yapılmıştır. PvAP2-ERF gen ailesinin yerel hizalama ve filogenetik analizleri, intron/exon yapısı, genlerinin kromozomlar üzerindeki dağılımı ve motif tahmini yapılmıştır. Ayrıca PvAP2-ERF genlerinin promotor yapıları ve miRNA hedefleri, gen ontolojisi ve fonksiyonel anlamlandırma işlemleri gerçekleştirilmiştir. AP2-ERF proteinleri arasındaki etkileşimler, amino asitlerin fiziksel ve kimyasal karakteristikleri analiz edilmiştir. Ek olarak PvAP2-ERF genlerinin ekspresyo seviyeleri in silico ve qRT-PCR analizi ile değerlendirilmiştir. Biyoinformatik analizler sonucunda PvAP2-ERF31 geni Gateway klonlama sistemiyle klonlanıp Agrobacterium ile tütüne aktarılmıştır. T1 Transgenik tütün adaylarının moleküler ve fizyolojik analizler yapılmıştır. T1 transgenik adaylar 200 mM NaCl içeren ortamlarda stres testine tabi tutulmuş ve transgenik tütün adayları sağlıklı bir şekilde çimlenmiş ve büyümüştür.