MANDA SÜTLERİNDEN İZOLE EDİLEN STAPHYLOCOCCUS AUREUS VE ESCHERİCHİA COLİ İZOLATLARININ MOLEKÜLER KARAKTERİZASYONU
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Mikrobiyoloji (Veteriner) Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2025
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: AHMET GEÇER
Danışman: Timur Gülhan
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışmada, Samsun ili Bafra İlçesinde Manda yetiştiriciliği yapılan işletmelerden klinik olarak sağlıklı görünen, mastitis problemi olmayan ve antibiyotik tedavisi uygulanmayan Anadolu Mandalarından alınan 100 adet süt numunesinden Staphylococcus aureus ve Escherichia coli izolatlarının moleküler karakterizasyonu ve bazı virülens genlerinin tespiti yapıldı. Ayrıca Staphylococcus aureus ve Escherichia coli izolasyonu ve identifikasyonu, izolatlarının RAPD-PZR yöntemi ile genotiplendirilmesi ve antibiyotik duyarlılık profillerinin belirlenmesi amaçlandı. 17 izolat Staphylococcus aureus olarak identiye edildi. İzolatların 9 (%52,4)'u clfa, 9 (%52,4)'ü hla, 7 (%41,17)'ü hlb, 7 (%41,17)'u fnbB geni açısından pozitif bulundu. İzolatların 9'unda ise iki ya da daha fazla virülens geni 7'sinde bir ya da daha fazla virülens geni belirlenirken, 7 izolatta ise incelenen virülens genlerin hiçbiri saptanamadı. 17 adet Staphylococcus aureus izolatın Kirby-Bauuer Disk Difuzyon Metodu ile belirlenen 17 (%100) Ampisilin, 17 (%100) Streptomisin, 16 (%94,1) Eritromisin, 13 (%76,4) Kloromfenikol, 12(%70,5) Tetrasiklin, 10 (%58,8) Sefalotine, 9 (%52,9) Enrofloksasin, 6 (%35,2) Gentamisin, 6 (%35,2) Sulfametaksazole dirençli bulundu. S.aureus izolatlarında filogenotik değerlendirme için yapılan RAPD-PCR ile benzerliklerin %59-96 arasında olduğu belirlendi. Escherichia coli'de ise 11 adet izolat identiye edildi. İzolatların 2 (%18,2)'ı aer, 2 (%18,2)' trat geni açısından pozitif bulundu. İzolatların sadece birisinde her iki virülens gen tespit edildi. İzole edilen 11 E. coli izolatından 10'u (% 90.9) streptomisine, 10'u (% 90.9) eritromisine, 9'u (% 81.8) sefalotine, 9'u (% 81.8) kloromfenikole, 9'u (% 81.8) ampisiline, 9'u (% 81.8) tetrasikline, 7'si (% 81.8) trimetoprim-sulfametaksazole, 6'sı (% 54.5) enrofloksasine ve 4'ü (% 54.5) gentamisine dirençli bulundu. Antibiyotik direnç genlerinin tespitinde ise (%18.2) tetB geni saptandı. Escherichia coli izolatlarında filogenotik değerlendirme için yapılan RAPD-PCR ile benzerliklerin %31-97 arasında olduğu belirlendi. Sonuç olarak, manda sütlerinin S. aureus ve E. coli açısından risk oluşturabileceği, izolatların önemli virülens genlerini taşıyabileceği ortaya konuldu. İzolatların virülens gen ve antibiyotik direnç patternleri açısından detaylı olarak incelenmesi gerektiği kanaatine varıldı.